Die Mission wird mithilfe modernster Radar- und Mikrowelleninstrumente den Anstieg des Meeresspiegels, Meeresströmungen und den Klimawandel verfolgen und hochpräzise Daten liefern, um die langfristige Umweltüberwachung zu verbessern und die Küstenplanung weltweit zu unterstützen.

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Sentinel-6B wird eine seit 1992 bestehende Satellitendatenreihe fortsetzen und so lückenlose Meeresspiegelbeobachtungen bis in die 2030er Jahre gewährleisten. Wissenschaftlern zufolge wird die Mission zudem das Verständnis der Küstenbedingungen verbessern, indem sie Messfehler in Küstennähe reduziert, und gleichzeitig Informationen zur Unterstützung von Wettervorhersagen, der Handelsschifffahrt, der Fischerei und der Notfallplanung liefern.