La cappella risale al XVI secolo, anche se la maggior parte della struttura originale è stata ricostruita dopo il devastante terremoto del 1755, con ulteriori modifiche apportate durante l'espansione all'inizio del XX secolo fino al 1965.
Tuttavia, alcuni elementi sono stati conservati, come l'arco in pietra del presbiterio e l'altare principale dedicato a Nostra Signora dell'Incarnazione, patrona della città.
Nel 2009 è iniziata una ristrutturazione trasformativa sotto la guida dell'artista visiva Lídia Rodrigues, invitata dall'allora parroco padre José Nunes. Il suo compito iniziale è stato quello di arrestare la diffusione del salnitro nella cappella, martoriata dai rigori del mare, e di ripristinare il carattere religioso della chiesa attraverso l'arte sacra contemporanea.
In seguito ha portato avanti un progetto molto più ambizioso, sviluppato in fasi successive nell'arco di 11 anni, unendo la bellezza dell'espressione artistica al trascendente e allo spirituale, che culminerà nel 2020.
Chi desidera visitarlo può ora esplorare uno spazio meditativo arricchito da 34 pannelli dipinti che abbracciano l'intera storia della Salvezza - 20 raffigurano i Misteri del Rosario, sette la Creazione e sette l'Apocalisse - accanto a un'immagine di Cristo Risorto al centro dell'altare.
I dipinti verticali, che elevano lo sguardo e il pensiero dell'osservatore, sono divisi dalle fessure rettangolari delle finestre in vetro colorato disegnate su misura per completare la narrazione biblica.
L'inaugurazione di questo progetto è stata ritardata a causa della pandemia di covidio-19, ma da allora ha attirato fedeli da tutto il mondo e continua a svolgere la sua missione di invitare chi passa di lì a un viaggio per incontrare Dio.