Hij studeerde geesteswetenschappen bij de jezuïeten en theologie bij de dominicanen. In 1676 werd hij tot priester gewijd en werkte hij enkele jaren in de regio Kanara in Zuid-India.

Na bijna tien jaar in Kanara keerde hij terug naar Goa, en in 1686 stichtte hij daar samen met een groep andere priesters een Oratorium van Sint-Filips Neri, waarbij hij advies en hulp kreeg van de Oratorianerhuizen die toen in Portugal waren gevestigd. Slechts een jaar later, in 1687, voelde hij zich geroepen om Goa te verlaten en als missionaris naar het eiland Ceylon, het huidige Sri Lanka, te gaan.

Hij bleef vierentwintig jaar op dat eiland en oefende zijn priesterambt uit onder zeer beperkende omstandigheden. Hij werd meedogenloos achtervolgd en vervolgd door de onderdrukkende Nederlandse calvinistische autoriteiten, die een einde wilden maken aan zijn eenzijdige maar succesvolle inspanningen om de Kerk weer op te bouwen en het katholicisme op Ceylon in stand te houden. Hij moest overal vermomd reizen en was genoodzaakt de sacramenten ’s nachts in het geheim te vieren.

Pater Vaz besloot zich te vestigen in het koninkrijk Kandy, in het binnenland van het eiland. Bij zijn aankomst daar werd hij als spion gearresteerd en in de gevangenis opgesloten. Hij werd vrijgelaten nadat hij had gebeden voor en een door iedereen als wonderbaarlijk beschouwde regenbui had bewerkstelligd, waarmee een einde kwam aan een langdurige droogte. Daarna verleende de boeddhistische koning van Kandy hem zijn persoonlijke bescherming.

In 1696 voegden zich verschillende paters van het Oratorium uit Goa bij hem op Ceylon, en werd daar een volwaardige missie opgericht. Pater Vaz wees de functie van apostolisch vicaris af; hij gaf er de voorkeur aan een eenvoudige missionaris te blijven. Naast zijn andere pastorale werkzaamheden vertaalde hij een catechismus en gebeden in de lokale talen, het Singalees en het Tamil. De mensen noemden hem ‘Sammanasu Swam’ – de engelachtige priester.

Begin 1711 wist hij dat hij op sterven lag. Op 16 januari ontving hij de laatste sacramenten, terwijl leden van zijn kudde rond zijn bed waren verzameld. Hij zei tegen hen: „Leef altijd volgens Gods inspiratie.” Hij stierf om middernacht. Hij was zestig jaar oud.

Helaas is de precieze verblijfplaats van zijn stoffelijke resten onzeker.

Hij werd op 21 juni 1995 in Sri Lanka door paus Johannes Paulus II zalig verklaard en werd daar op woensdag 14 januari 2015 door paus Franciscus heilig verklaard.

Zijn feestdag wordt gevierd op 16 januari.