Studiował nauki humanistyczne u jezuitów, a teologię u dominikanów. W 1676 roku przyjął święcenia kapłańskie i przez kilka lat pracował w regionie Kanara w południowych Indiach.

Po prawie dziesięciu latach spędzonych w Kanarze powrócił do Goa, gdzie w 1686 roku wraz z grupą innych księży założył Oratorium św. Filipa Nereusza, korzystając z porad i pomocy domów oratoryjskich działających wówczas w Portugalii. Zaledwie rok później, w 1687 r., poczuł powołanie do opuszczenia Goa i wyjazdu jako misjonarz na wyspę Cejlon, dzisiejszą Sri Lankę.

Pozostał na tej wyspie przez dwadzieścia cztery lata, pełniąc swoją posługę kapłańską w bardzo trudnych warunkach. Był bezlitośnie ścigany i prześladowany przez opresyjne holenderskie władze kalwińskie, które chciały położyć kres jego samotnym, ale skutecznym wysiłkom na rzecz odbudowy Kościoła i utrzymania katolicyzmu przy życiu na Cejlonie. Musiał wszędzie podróżować w przebraniu i był zmuszony do potajemnego sprawowania sakramentów w nocy.

Ojciec Vaz postanowił osiedlić się w królestwie Kandy, położonym w głębi wyspy. Po przybyciu na miejsce został aresztowany jako szpieg i osadzony w więzieniu. Został uwolniony po tym, jak modlił się o deszcz i doprowadził do tego, co wszyscy uznali za cudowne, kończące długotrwałą suszę. Następnie buddyjski król Kandy zapewnił mu swoją osobistą ochronę.

W 1696 r. kilku ojców z Oratorium w Goa dołączyło do niego na Cejlonie i utworzono tam prawidłowo zorganizowaną misję. O. Vaz odmówił przyjęcia stanowiska wikariusza apostolskiego, woląc pozostać zwykłym księdzem misjonarzem. W ramach swojej działalności duszpasterskiej przetłumaczył między innymi katechizm i modlitwy na lokalne języki: syngaleski i tamilski. Ludzie nazywali go „Sammanasu Swam” – anielskim księdzem.

Na początku 1711 roku wiedział już, że umiera. 16 stycznia przyjął ostatnie namaszczenie w otoczeniu wiernych zgromadzonych przy jego łóżku. Powiedział im: „Zawsze żyjcie zgodnie z natchnieniem Bożym”. Zmarł o północy. Miał sześćdziesiąt lat.

Niestety, dokładne miejsce spoczynku jego szczątków pozostaje nieznane.

Został beatyfikowany na Sri Lance przez papieża Jana Pawła II 21 czerwca 1995 r., a kanonizowany tam przez papieża Franciszka w środę, 14 stycznia 2015 r.

Jego święto obchodzone jest 16 stycznia.