El código ético de la profesión protege este derecho cuando el acto vulnera principios éticos, morales o religiosos, o cuando el médico considera que se está ejerciendo presión sobre su criterio profesional; en tales casos, debe presentar una justificación por escrito a la dirección clínica del centro sanitario.

Este punto queda claro en un dictamen publicado por el Colegio de Medicina General y de Familia e incluido en el mismo informe, ya que evaluar la aptitud de una persona para conducir implica valorar los riesgos para terceros en situaciones sociales complejas.

Existe un conflicto ético y profesional inherente al hecho de denegar o imponer condiciones para la expedición de un certificado, ya que esto podría dañar la relación de confianza de larga data entre el paciente y su médico; por este motivo, la Asociación Médica afirma que no se debe exigir a los médicos que expidan dichos certificados sin excepción.